Page 35 - bideb_bulten_08.07.2022_digital
P. 35

BİDEB SÖYLEŞİLERİ







































                                            akciğerlerinin transkripsiyonel     araştırılmıştır. SARS-CoV-2'nin
                                            yanıtına aracılık eden              etkilerinin, enfeksiyonun erken
        “… proje kapsamında                 mekanizmalarının/yolaklarının       evrelerinde meydana gelen
        başladığımız bu çalışmamız          araştırılması ile COVID-19          biyolojik süreçlerle birlikte diğer
        ilaç araştırmalarına katkı          için evrensel bir "tanısal gen      solunum yolu virüslerinin etkileri
        sunmak için halen devam             imzası" belirlemekti.  Bu amaçla,   ile karşılaştırılması da etkili tedavi
        etmektedir”                         projemizde öncelikle açık-kaynak    yöntemleri ve ilaç geliştirme
                                            veri tabanlarından yüksek verimli   açısından önemlidir. Bu sebeple
        Şiddetli Akut Solunum Sendromu      gen ekspresyonu (transkriptom)      proje kapsamında başladığımız
        (SARS-CoV-2) virüsünün neden        verileri elde edilmiştir. Elde edilen   bu çalışmamız ilaç araştırmalarına
        olduğu COVID-19, tüm dünyada        ilk veri kümeleri, hem sahte (mock)  katkı sunmak için halen devam
        yüksek ölüm ve mutasyon oranıyla    işlem görmüş hem de SARS-CoV-2  etmektedir. Proje sürecinde ve
        devam eden bir salgındır ve etkili   ile enfekte olmuş pluripotent      sonrasında elde edilen sonuçlar
        tedaviler geliştirmek için küresel bir  kök hücreleri ve ayrıca ölen    Danışmanın Dr. Öğr. Üyesi
        öncelik olmaya devam etmektedir.    COVID-19 hastalarından alınan       Athanasia Pavlopoulou ve Muğla
        Bu nedenle, akciğer koronavirüs     akciğer dokularının transkriptomik   Üniversitesi İstatistik bölümü
        enfeksiyonuna karşı insan konakçı   profillerini içeriyordu. Buna bağlı   öğretim üyesi Doç. Dr. Eralp Doğu
        yanıtının altında yatan moleküler   olarak bu biyolojik verilerden      ile birlikte 10-11 Eylül 2021’de
        mekanizmaları aydınlatmak,          anlamlı bilgileri ayıklamak,        düzenlenen 14. Uluslararası
        COVID-19 hastalarının teşhisi ve    işlemek ve analiz etmek için        Sağlık Bilişimi ve Biyoinformatik
        izlenmesinin yanı sıra etkili anti-  interaktif bir iş akışı tasarlandı.   Sempozyumu’nda (HIBIT-2021)
        koronaviral terapötik stratejilerin   Çalışmamız kapsamında SARS-       poster olarak sunuldu.
        rasyonel tasarımı için gereklidir.    CoV-2 ile enfekte akciğer doku/
        Bu çalışmalara katkı sunmak adına   hücre ve kontrol örneklerinin farklı
        dahil olduğumuz bu projenin nihai   transkriptomik profillere sahip olup
        hedefi, gelişmiş biyoinformatik     olmadığı incelenerek elde edilen
        ve istatistiksel metodolojilerin    sonuçların SARS-CoV-2 ile enfekte
        kullanıldığı interaktif bir yaklaşımla  olmuş akciğer dokularının genomik
        SARS-CoV-2 ile enfekte insan        karmaşıklığını ne ölçüde yansıtacağı
                                                                                                             33
   30   31   32   33   34   35   36   37   38   39   40